Depois dos alucinantes embates contra a fumaça branca, um grupo misterioso com autoridade governamental ilimitada chega para investigar os estranhos acontecimentos. Morando em um hotel, John precisa continuar seu trabalho, esconder o marciano e lidar com um relacionamento em ruínas. Enquanto isso, Bridget tem que lidar com as revelações de John e cuidar sozinha de Tyler.